河南科技大学科技园设有专业的管理机构和运营团队，负责科技园的管理和运营。河南科技大学科技园有限责任公司是科技园专职管理机构，负责科技园的日常行政管理，执行学校关于科技园的相关决议；负责制订和落实科技园发展规划及年度工作计划；负责制订入驻科技园项目（企业）考核办法，每年对入驻科技园的项目（企业）进行考核；负责申请入驻科技园的项目（企业）的评审筛选，并为入驻科技园项目（企业）提供咨询服务、导师辅导、投融资对接、扶持资金申请等服务。

河南科技大学科技园有限责任公司由高级职称的专家学者、专职的创业培训人员等组成，负责科技园的发展规划、培训帮扶计划、种子资金使用和投融资等重大事项决策。